Las comisiones se comen la rentabilidad. Entonces, en especial en tus primeros años cotizando te conviene estar en la AFP que cobre menos.
Después, cuando tu ahorro vaya creciendo, debieras fijarte en las rentabilidades más que solo en la comisión.
Las rentabilidades son públicas y las encuentras en el sitio web de la Superintendencia de Pensiones.